Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC78A2IDD5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms