Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SMG5Q9UPR3 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms