Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL495P-201ENST00000616925 237 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CDK2AP2P1-201ENST00000617479 328 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 STPG3-205ENST00000620243 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC093495.1-214ENST00000627116 559 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP001206.1-201ENST00000635554 720 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC084337.2-202ENST00000640959 595 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 IFT46-201ENST00000264020 1819 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CHEK2-207ENST00000403642 1359 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CCDC89-201ENST00000316398 1412 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZBBX-203ENST00000392766 3250 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GLRA4-201ENST00000372617 1795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RBM26-AS1-201ENST00000456602 1756 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HIST1H4F-201ENST00000244537 312 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SLPI-201ENST00000338380 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR1J4-201ENST00000340750 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TRBV6-8-201ENST00000390376 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MORF4L1P1-201ENST00000404582 967 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC007359.1-201ENST00000417910 745 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPSAP8-201ENST00000429844 889 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC099066.3-201ENST00000434499 301 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR51R1P-201ENST00000435309 952 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC008175.1-202ENST00000439653 745 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MRPS16P2-201ENST00000445106 408 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NME6-211ENST00000447314 621 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC000067.1-201ENST00000452326 287 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 KCNAB1-AS1-201ENST00000467794 456 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL12P36-201ENST00000470623 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR9A3P-202ENST00000485185 878 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 EGFLAM-207ENST00000506135 889 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC233724.11-201ENST00000508480 404 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 BIN3-207ENST00000520292 775 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01024-206ENST00000522747 1044 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP002957.1-201ENST00000525952 406 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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