Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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