Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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