Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
EIF4EBP1Q13541 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms