Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms