Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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