Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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GPS1Q13098 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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GPS1Q13098 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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GPS1Q13098 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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GPS1Q13098 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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GPS1Q13098 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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GPS1Q13098 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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