Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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