Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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