Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBQ06643 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LTBQ06643 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms