Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FAM3AP98173 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms