Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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