Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
COPS7AQ9UBW8 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms