Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 CSAG2-201ENST00000535353 237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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