Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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C17orf47Q8NEP4 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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C17orf47Q8NEP4 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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C17orf47Q8NEP4 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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C17orf47Q8NEP4 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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C17orf47Q8NEP4 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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C17orf47Q8NEP4 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
C17orf47Q8NEP4 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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