Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms