Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CHD4Q14839 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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