Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC01568-201ENST00000554640 2544 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms