Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms