Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1BQ00975 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms