Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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HOXA3O43365 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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