Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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