Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SGF29Q96ES7 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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