Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PRYP1-201ENST00000412474 445 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC092373.1-201ENST00000414951 490 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PRYP2-201ENST00000416652 492 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RTCA-AS1-201ENST00000421185 423 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC090044.1-201ENST00000423193 497 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL36P20-201ENST00000423702 319 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CBWD5-208ENST00000429800 1234 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL10P3-201ENST00000431607 468 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE9P2-201ENST00000447321 604 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL139220.2-215ENST00000453688 654 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DMKN-237ENST00000472252 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC114964.1-201ENST00000502306 1111 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 BX293995.1-201ENST00000502880 755 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC026787.1-201ENST00000504182 420 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NCBP2L-201ENST00000509000 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC060765.1-202ENST00000518367 257 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP003692.1-201ENST00000521706 796 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC064807.3-201ENST00000523810 470 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TUBB4BP4-201ENST00000527023 304 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NDUFA9-206ENST00000540688 642 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZFHX2-AS1-203ENST00000556354 931 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR3131-201ENST00000583592 63 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01535-204ENST00000591116 815 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC005197.1-201ENST00000597769 683 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CASC15-205ENST00000606336 1288 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL462P-201ENST00000610302 261 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TRBV10-3-201ENST00000611462 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL422P-201ENST00000612850 261 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CBWD1-222ENST00000613508 1143 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PDE4DIP-249ENST00000620605 823 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL343P-201ENST00000620904 261 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL640P-201ENST00000622591 261 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL117339.1-203ENST00000638066 888 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC106774.9-201ENST00000638668 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC233724.17-201ENST00000639073 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC106774.8-201ENST00000639081 597 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL596275.2-202ENST00000641180 956 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SLC17A2-202ENST00000360488 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ACTR6-209ENST00000551617 1715 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC009044.1-201ENST00000624577 1798 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms