Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CA9Q16790 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CA9Q16790 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms