Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZFYVE26-207ENST00000555452 7309 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CLVS2-201ENST00000275162 11485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 KALRN-201ENST00000240874 6537 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 KLHL3-201ENST00000309755 6806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GK5-201ENST00000392993 9837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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