Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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SIX1Q15475 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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SIX1Q15475 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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SIX1Q15475 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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SIX1Q15475 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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SIX1Q15475 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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SIX1Q15475 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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