Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB39AQ14964 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms