Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms