Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ITGA9Q13797 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ITGA9Q13797 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms