Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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