Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CUL4AQ13619 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CUL4AQ13619 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CUL4AQ13619 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CUL4AQ13619 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CUL4AQ13619 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CUL4AQ13619 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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