Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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CUL3Q13618 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL3Q13618 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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