Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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