Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC012370.2-202ENST00000600508 1099 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
MTMR3Q13615 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms