Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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