Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNB3Q05901 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms