Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AIF1L-202ENST00000372297 418 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RNVU1-17-201ENST00000384619 164 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ATP5G1-202ENST00000393366 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 UQCR10-202ENST00000401406 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL359738.1-201ENST00000419667 430 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC079779.2-202ENST00000427831 392 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL353052.1-201ENST00000428673 818 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC004448.3-201ENST00000435953 543 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL512306.3-201ENST00000453895 683 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL132838.1-201ENST00000469219 542 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RN7SL762P-201ENST00000469864 289 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RPSAP55-201ENST00000477347 876 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RPS10P5-201ENST00000492704 531 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 CUTA-213ENST00000494751 731 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LINC02213-201ENST00000504650 518 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AP001453.2-202ENST00000538355 431 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RPEP6-201ENST00000546228 626 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC025161.1-201ENST00000552481 591 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 NDUFA6-AS1-208ENST00000600968 662 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC091393.1-201ENST00000605088 598 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 GPX2-205ENST00000612794 1084 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL121890.4-201ENST00000616569 609 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL590644.1-202ENST00000634972 590 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MOV10L1-205ENST00000395858 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 OGDHL-201ENST00000374103 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 TRAPPC6B-202ENST00000347691 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 RACGAP1-201ENST00000312377 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 ZNF709-201ENST00000397732 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 ABI2-211ENST00000422511 2718 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 TPD52L3-202ENST00000344545 2296 ntAPPRIS P4 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 OPHN1-201ENST00000355520 7879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 CNTN4-205ENST00000427331 4980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 MIA3-202ENST00000344507 2026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 GTF2H2B-204ENST00000513202 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 FAM173B-201ENST00000280330 1928 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 NUP85-203ENST00000540768 1926 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 FAM162A-203ENST00000477892 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 HTR3C-201ENST00000318351 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 SCN5A-210ENST00000455624 7170 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 TACC2-202ENST00000334433 9377 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 KRTAP16-1-201ENST00000391352 1554 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 TMEM215-201ENST00000342743 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC108120.3-201ENST00000505953 1510 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 GALNT8-201ENST00000252318 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 KRT18P59-202ENST00000534728 3338 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 DYRK4-211ENST00000540757 3272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 RETSAT-201ENST00000295802 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 WDR36-204ENST00000513710 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 WDR20-201ENST00000299135 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC114737.1-201ENST00000434531 453 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC005522.2-201ENST00000479299 453 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC084033.3-201ENST00000551421 451 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 USP35-201ENST00000526425 3770 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 URGCP-202ENST00000402306 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms