Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CENPFP49454 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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