Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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HOXD13P35453 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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HOXD13P35453 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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HOXD13P35453 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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HOXD13P35453 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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