Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 SMIM8-204ENST00000392863 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TRHP20396 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC093904.4-201ENST00000565044 3273 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 MEF2C-239ENST00000636294 2576 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL353583.1-201ENST00000624195 1855 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 HS3ST5-202ENST00000411826 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 SPEF2-201ENST00000282469 3026 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRHP20396 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 ZC4H2-203ENST00000447788 2649 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 ANKRD46-206ENST00000520552 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 ZFY-204ENST00000449237 3464 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 LINC01310-201ENST00000380981 4015 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 GPN1-210ENST00000515877 1646 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 GLI1-207ENST00000543426 3394 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AIMP1-201ENST00000358008 2412 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL591896.1-201ENST00000420211 491 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL606490.6-201ENST00000453735 523 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 THBS3-210ENST00000541576 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 FPR2-202ENST00000598776 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC117529.1-201ENST00000505789 2023 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 IFT122-201ENST00000296266 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 LRRC4C-207ENST00000619527 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 KCNK2-202ENST00000391895 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 EXT2-203ENST00000395673 3454 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 RCAN1-208ENST00000482533 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRHP20396 CCDC18-201ENST00000343253 4867 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 POLR2M-202ENST00000380557 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 KALRN-201ENST00000240874 6537 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 WNT2B-201ENST00000256640 2819 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRHP20396 KRIT1-202ENST00000394503 2827 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms