Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL450313.1-201ENST00000366376 452 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPSAP52-201ENST00000489520 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC01125-248ENST00000627284 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC00598-212ENST00000637124 905 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CXorf57-201ENST00000372544 3607 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 FGFR2-206ENST00000358487 4255 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PIGR-201ENST00000356495 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PACRG-202ENST00000366888 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 UBR4-201ENST00000375218 4031 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AKR1B15-201ENST00000423958 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL365295.1-204ENST00000425648 553 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 Z99943.2-201ENST00000507585 266 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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