Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms