Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC245100.4-203ENST00000635493 1357 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms