Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 PPP3R2-202ENST00000636434 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 CU633967.1-204ENST00000624627 1604 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 CDY2B-201ENST00000382867 1961 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 KLRB1-201ENST00000229402 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC104078.1-201ENST00000499292 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 PHYKPL-205ENST00000476170 824 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL132855.1-201ENST00000557368 207 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 TMEM116-201ENST00000355445 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 SNORA71D-201ENST00000363484 134 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 OR4E2-201ENST00000408935 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
CSPP1Q1MSJ5 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms