Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms