Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SND1-IT1-201ENST00000623342 2481 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KLF7-IT1-201ENST00000428777 655 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 PRSS51-203ENST00000636217 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CCDC85BQ15834 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms