Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AL035530.2-201ENST00000607391 1675 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
R3HDM1Q15032 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms